พันธุศาสตร์ของการกระจายไขมันแบบไดมอร์ฟิก

ความเจ็บป่วยที่เกี่ยวข้องกับโรคอ้วนนั้นรุนแรงขึ้นโดยโรคอ้วนลงพุง ซึ่งสามารถวัดได้เมื่ออัตราส่วนรอบเอว

ต่อสะโพกปรับตามดัชนีมวลกาย (WHRadjBMI) ที่นี่เราระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับโรคอ้วนและ WHRadjBMI และระบุลักษณะตัวเสริมที่ไวต่ออัลลีลที่คาดว่าจะควบคุมยีน WHRadjBMI ในผู้หญิง เราพบว่าตัวแปรที่เกี่ยวข้องกับอัตราส่วนเอวต่อสะโพกหลายตัวทำแผนที่ภายใน Alu retrotransposons เฉพาะของเจ้าคณะซึ่งมีมาตรฐาน DNA ที่เกี่ยวข้องกับการสร้างความแตกต่างของ adipocyte สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าองค์ประกอบทางพันธุกรรมของการกระจายไขมันในมนุษย์อาจเกี่ยวข้องกับตัวเลือกร่วมกันของ retrotransposons เป็นตัวเพิ่มไขมัน เราประเมินบทบาทของยีนที่เกี่ยวข้องกับ WHRadjBMI เพศหญิงที่แข็งแกร่ง

ที่สุดSNX10ในชีววิทยาไขมัน เราพิจารณาแล้วว่าจำเป็นสำหรับการสร้างความแตกต่างและการทำงานของ adipocyte ของมนุษย์ และมีส่วนร่วมในการขยายไขมันที่เกิดจากอาหารในหนูตัวเมีย แต่ไม่ใช่ตัวผู้ ข้อมูลของเราระบุยีนและกลไกการกำกับดูแลที่รองรับการกระจายไขมันเฉพาะเพศหญิงและไกล่เกลี่ยความผิดปกติของการเผาผลาญในผู้หญิง

นี่คือตัวอย่างของเนื้อหาที่สมัครสมาชิกเข้าถึงผ่านสถาบันของคุณตัวเลือกการเข้าถึงเพิ่มเติม:เข้าสู่ระบบเรียนรู้เกี่ยวกับการสมัครสมาชิกสถาบันความพร้อมใช้งานของข้อมูลการแสดงออกของยีนที่เผยแพร่ก่อนหน้านี้และข้อมูล GWAS ที่ใช้ในการศึกษานี้สามารถเข้าถึงได้ผ่านทางGTEx

UKBB(และGIANTConsortium ได้รับข้อมูล chromHMM 15 สถานะจากนิวเคลียสไขมันที่. ข้อมูลอื่นๆ ได้แก่ ข้อมูลการทำซ้ำ RepeatMasker hg38, การอนุรักษ์ hg38 phastCons และชุดประกอบจีโนม GRCh38 และ GRCh37

คำอธิบายประกอบพื้นฐานที่ใช้สำหรับการคำนวณการเพิ่มปริมาณ ยีนเฉพาะเนื้อเยื่อ LDSC-SEG สามารถดูได้ที่ข้อมูล MPRA เปรียบเทียบจาก Ulirsch และคณะ สามารถขอรับ25 ได้จากห้องปฏิบัติการ Sankaran ข้อมูลเปรียบเทียบจาก Khetan et al. 49ได้ที่https:

. ข้อมูลลำดับที่สร้างขึ้นในการศึกษานี้สามารถพบได้ใน NCBI Sequence Read Archive ผ่านทางรหัสภาคยานุวัติ BioProject PRJNA847334. ตารางที่มีข้อมูลที่สร้างขึ้นในการศึกษานี้ รวมถึงการเสริมคุณค่า LDSC-SEG สำหรับโรคอ้วนและ WHR, การประมาณสัดส่วนประเภทเซลล์ xCell, โรคอ้วนและยีนที่เกี่ยวข้องกับ WHRadjBMI ที่ระบุในกระดาษ, ตัวแปรที่ทดสอบใน MPRA พร้อมระดับกิจกรรมตัวเสริมและสถานะนัยสำคัญ ข้อมูลการเพิ่มคุณค่าของปัจจัยการถอดความ, คุณสมบัติ LipocyteProfiler ที่สำคัญ, การทำให้ล้มลงของ SNX10 shRNA และข้อมูลเมาส์ SNX10 ได้รับการอัปโหลดไปยัง Open Science Framework ในที่เก็บชื่อ ‘พันธุศาสตร์ของการกระจายไขมัน dimorphic ทางเพศในมนุษย์’

ความพร้อมใช้งานของรหัสเว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่นในวิธีการ โค้ดทั้งหมดที่ใช้สร้างตัวเลขและข้อมูล ที่รวมอยู่ในการศึกษานี้มีอยู่ที่

แทงบอล

 

 

Releated